标准菌株是属于种属鉴定的规范参照菌，而质控菌株，往往是从功能或用途上讲的，通常是以标准菌株用来做质控的。
标准菌株使用注意事项：
1、选择合适的培养基：勿使用选择性培养基。一般使用非选择性的增菌培养基，因为微生物在选择性培养基中生长某些生物特性可能丢失，保藏的菌种的生物特性可能与标准菌株特性不同。
2、菌液的浓度：菌液的浓度一般越大，菌种保存时间越长。保藏时细菌常使用菌液，霉菌常用无菌水或生理盐水制备成的孢子悬液。
3、甘油浓度：甘油终浓度一般为10%~20%。由于甘油原液太粘稠，需要配制合适的甘油-水溶液。
4、对菌种进行保藏时注意慢冻快化，冷冻时降温速率保持1℃/min,复苏时用37℃水浴融化，能够保证菌种大的成活率。当冷冻菌种融化后，应避免再次冷冻，否则菌体的生存率会大幅度降低。
